Pojasnjeno: Kako hitro se širi novi sev koronavirusa? Ali bo to vplivalo na cepljenje?

Nov sev koronavirusa v Združenem kraljestvu: Indija in številne druge države so prekinile lete v in iz Združenega kraljestva. Katere mutacije so privedle do različice koronavirusa, ki je povzročila zaskrbljenost? Kako hitro se je razširil? In ali bo to vplivalo na cepljenje?

Leti iz Velike Britanije so odpovedani na letališču Cointrin v Ženevi, Švica, 21. decembra 2020. (Reuters Foto: Denis Balibouse)

V ponedeljek Indija prekinili vse lete iz in v Združeno kraljestvo do 31. decembra, zaradi pomislekov glede a nova varianta SARS-CoV-2, ki se tam hitro širi in raste. Tudi številne druge države so prekinile lete v Združenem kraljestvu in uvedle omejitve potovanj.

Kakšne so te skrbi, ki vodijo do omejitev potovanj?

Prejšnji teden se je izkazalo, da je nova različica SARS-CoV-2 razlog za hiter porast primerov Covid-19 v južni in vzhodni Angliji. Imenuje se kot VUI (Variant Under Investigation) 202012/01 ali linija B.1.1.7.

V zadnjih nekaj dneh smo po zaslugi naše genomske sposobnosti svetovnega razreda odkrili novo različico koronavirusa, ki je lahko povezana s hitrejšim širjenjem na jugu Anglije, je britanski zdravstveni minister Matt Hancock povedal za House of Commons dne. 14. december. Britanske oblasti so o varianti že obvestile Svetovno zdravstveno organizacijo.

Public Health England (PHE) je objavil, da je bilo do 13. decembra ugotovljenih 1.108 primerov s to različico, pretežno v južni in vzhodni Angliji. PHE sodeluje s partnerji pri preiskavi in ​​namerava svoje ugotovitve deliti v naslednjih 2 tednih, je dejal.

Kakšna je varianta?

Različico je v genomskem nadzoru identificiral COVID-19 Genomics UK (COG-UK), konzorcij, ki analizira podatke o sekvenciranju genoma iz Združenega kraljestva. COG-UK največ prispeva k globalni bazi podatkov Covid-19 GISAID.

Različica je posledica več mutacij v spike proteinu novega koronavirusa SARS-CoV-2, pa tudi mutacij v drugih genomskih regijah virusa RNA. Preliminarna analiza kaže, da je bolj prenosljiv kot prejšnje različice v obtoku. COG-UK je eno od teh mutacij identificiral kot N501Y, na območju spike proteina, ki se veže na ključni protein v človeški celici, receptor ACE2. To je bil znak, da lahko spremembe teoretično povzročijo, da virus postane bolj nalezljiv. Prizadevanja so v teku, da se potrdi, ali katera od teh mutacij prispeva k povečanemu prenosu, je dejal konzorcij.

Kaj do zdaj vemo o prenosljivosti in resnosti bolezni?

V nedeljo je PHE dejal, da podatki iz sekvenciranja celotnega genoma, epidemiologije in modeliranja kažejo, da se nova varianta prenaša lažje kot drugi sevi.

Vendar pa je tudi poudaril, da ni dokazov, da bi ta varianta bolj verjetno povzročila hudo bolezen ali smrt. … Vendar nadaljujemo preiskave, da bi to bolje razumeli, je zapisano. Povedali so, da je umrljivost kazalnik, ki zaostaja in bo to nenehno spremljal v prihodnjih tednih.

PHE je dejal, da še ne pozna mehanizma za to povečanje prenosa. Vemo, da lahko mutacije v spike proteinu, delu virusa, zaradi katerega je nalezljiv, spremenijo način interakcije virusa s človeškimi celicami, je dejal.

Povedalo je, da dokazi kažejo, da so se stopnje okužb na geografskih območjih, kjer je ta sev krožil, povečale hitreje, kot je bilo pričakovano, in dokazi modeliranja so pokazali, da ima ta varianta višjo stopnjo prenosa kot druge različice v trenutnem obtoku.

Nov sev koronavirusa v Združenem kraljestvu: Policist v ponedeljek po zaprtju pristanišča Dover usmerja promet na vhodu v zaprti trajektni terminal v Doverju v Angliji. (AP fotografija)

Koliko skrbi višja prenosljivost?

18. decembra je svetovalna skupina za nevarnosti novih in nastajajočih respiratornih virusov (NERVTAG), ki svetuje vladi Združenega kraljestva glede grožnje, ki jo predstavljajo novi in ​​nastajajoči respiratorni virusi, dejala, da bi nova različica lahko povečala število razmnoževanja bolezni do 0,93 . Povedalo je, da ima zmerno zaupanje, da nova različica kaže znatno povečanje prenosljivosti v primerjavi z drugimi različicami.

Strokovno telo pa je ugotovilo, da trenutno ni dovolj podatkov za sklepanje o osnovnem mehanizmu povečane prenosljivosti, starostni porazdelitvi primerov in resnosti bolezni. Povedalo je, da so bile ugotovljene 4 smrti v približno 1000 primerih, vendar je potrebno nadaljnje delo, da se ta stopnja smrtnosti primerja s primerljivimi nizi podatkov.

Lokacija mutacij v domeni, ki veže receptorje, konicastega glikoproteina vzbuja možnost, da se ta varianta antigensko razlikuje od prejšnjih variant. Med 915 osebami s to različico so bile ugotovljene štiri verjetne ponovne okužbe, vendar je potrebno nadaljnje delo za primerjavo te stopnje ponovne okužbe s primerljivimi nizi podatkov, je dejal.

V nedeljo je poročilo o oceni nevarnosti, ki ga je objavil Evropski center za preprečevanje in obvladovanje bolezni, dejalo, da filogenetska analiza razkriva, da se grozd razlikuje za 29 nukleotidnih substitucij od prvotnega seva Wuhan. Tri sekvence z Danske in ena iz Avstralije iz vzorcev, zbranih novembra 2020, se združujejo z različico v Združenem kraljestvu, kar najverjetneje kaže, da je prišlo do mednarodnega širjenja, čeprav obseg ostaja neznan.

Nov sev koronavirusa v Združenem kraljestvu: pristanišče Dover se zapre, ko države EU uvedejo prepoved potovanja iz Združenega kraljestva. (Foto Reuters)

Toda ali se virus še ni mutiral?

Kadar koli se virus razmnožuje in kroži v človeški populaciji, se mutacije pojavijo naravno, s hitrostjo približno ene do dveh mutacij na mesec v globalni filogeniji.

Pravzaprav za SARS-CoV-2 COG-UK pravi, da je trenutno približno 4000 mutacij v beljakovini konica. Različica D614G je bila prej dominantna sorta, ker se je zelo zlahka širila. Še en sev, ki izvira iz španskih kmečkih delavcev, 20A. EU1, se poleti hitro razširi po Evropi.

Težko je predvideti, ali je katera koli mutacija pomembna, ko se prvič pojavi, v ozadju nenehnega pojavljanja novih mutacij. Razumevanje njihovega pomena je morda mogoče na podlagi eksperimentalnega dela, ki kaže povezavo med mutacijo in subtilno spremembo v biologiji virusa. Vendar pa bi bilo potrebno veliko časa in truda, da bi preizkusili učinek več tisoč kombinacij mutacij, je dejal COG-UK.

Ali bo to vplivalo na razvoj in odziv cepiva?

V nedeljo so oblasti Združenega kraljestva sporočile, da se nadaljnje laboratorijsko delo izvaja kot prednostna naloga, da bi to razumeli. Trenutno ni dokazov, ki bi kazali, da cepivo Pfizer ne bi zaščitilo ljudi pred novim sevom, je dejal PHE.

Delite S Prijatelji: