Pojasnjeno: Razumevanje obilne, zelo prenosljive mutacije koronavirusa

Mutacije Covid-19: Do zdaj je bilo po vsem svetu dokumentiranih 12.000 mutacij v več kot 3,2 milijona primerov. Ugotovljeno je bilo, da je ena mutacija najbolj razširjena. Prvič so ga opazili na Kitajskem in v Nemčiji.

Virusi RNA, kot je SARS-CoV-2, mutirajo počasi, saj potrebujejo gostitelja (človeško celico), da se razmnožujejo. (Datoteka s fotografijo/predstavništvo)

Koronavirus SARS-CoV-2 nenehno mutira, vendar je ena mutacija raziskovalcem pritegnila pozornost zaradi svoje številčnosti. Ta mutacija, imenovana D614G, je bila bolj prenosljiva kot večina drugih.

Kaj je mutacija D614G?

Vsi virusi mutirajo, da se prilagodijo oviram, ki jih postavljajo ljudje. Virusi RNA, kot je SARS-CoV-2, mutirajo počasi, saj potrebujejo gostitelja (človeško celico), da se razmnožujejo.

Do zdaj je bilo po vsem svetu dokumentiranih 12.000 mutacij v več kot 3,2 milijona primerov. Ugotovljeno je bilo, da je ena mutacija najbolj razširjena. Prvič so ga opazili na Kitajskem in v Nemčiji, vendar je pritegnil pozornost, ko se je pojavil v več primerih po Evropi in sčasoma v ZDA, Kanadi, Avstraliji in Indiji. Pri tej mutaciji glicin (G) nadomesti asparaginsko kislino (D) na 614. mestu v aminokislini. Zato se je mutacija imenovala 'D614G'.

IND614G,G (glicin) nadomešča D (asparaginsko kislino) na 614. mestu. (Koberet al/Cell)

Zakaj je ta mutacija drugačna od drugih?

Da bi to razumeli, moramo razumeti, kako SARS-CoV-2 vstopi v človeško celico. Aminokisline, pri katerih pride do mutacije, se nahajajo v spike proteinu virusa. Beljakovine spike se vežejo z receptorjem ACE2 na človeški celici in pridobijo vstop.

Dr Rajesh Pandey, znanstvenik na CSIR-Inštitutu za genomiko in integrativno biologijo, je pojasnil, da so peptidi v spike proteinu tisti, ki se zaklenejo z receptorjem ACE2. Pri mutaciji D614G se odpreta dva od treh peptidov, kar poveča možnosti za vstop v človeško celico. Predstavljajte si roko s tremi prsti. Če se odpre samo en prst, ima omejen dostop do pobiranja predmetov, če pa se odpreta dva prsta, lahko pobereta več predmetov. Dva peptida povečata možnosti, da virus vstopi v človeško celico.

Ker njegova narava omogoča večjo možnost vstopa v gostiteljsko celico kot drugi mutirani sevi, ima D614G višjo stopnjo prenosa. GISAID, globalna baza podatkov o virusih, ki je dokumentirala vse krožeče seve SARS-CoV2, kaže, da je mutirani sev od marca dalje v Evropi pridobil na pomenu.

Ekspresno razloženoje zdaj vklopljenoTelegram. Kliknite tukaj, da se pridružiš našemu kanalu (@ieexplained) in bodite na tekočem z najnovejšimi

Kakšne so posledice tega?

Virus mutira vsakič, ko se razmnoži v človeški celici, da se prilagodi in preživi. Ta mutacija pomaga virusu narediti točno to. Do začetka marca je bila ta mutacija redka, vendar je pridobivala prevlado v Evropi, kažejo podatki GISAID.

V prispevku v Cell so opazili: pred 1. marcem 2020 so ga (D614G) našli v 10 % od 997 globalnih zaporedij; med 1. marcem in 31. marcem 2020 je predstavljal 67 % od 14.951 zaporedij; in med 1. aprilom in 18. majem 2020 je predstavljal 78 % od 12.194 zaporedij.

Prednatisnjeni papir v Medrxivu je ugotovil, da so imeli bolniki, okuženi s to mutacijo, bistveno večjo obremenitev z virusom v nazofarinksu ob začetni diagnozi. Študija je sekvencirala genome 5.085 sevov SARS-CoV-2 v Houstonu.

Sev je zrasel, hitro se prenaša zaradi lahkotnosti, s katero vstopa v celico. To je tisto, kar je povzročilo razburjenje, je dejal mikrobiolog dr. Jayanthi Shastri iz laboratorija Kasturba v Mumbaju. Shastri je dejal, da so začetne študije pokazale, da lahko D614G povzroči več prenosa in hude simptome. Sprva smo opazili hudo infektivnost, a sčasoma se je v naših vzorcih pokazalo, da infektivnosti ni mogoče neposredno povezati z mutacijo, vlogo igrajo tudi drugi komorbidni dejavniki, je dejala. Zaenkrat ni dovolj longitudinalnih študij, da bi vzpostavili neposredno povezavo med D614G in povečano umrljivostjo. Za to moramo narediti sekvenciranje genoma za več hudih bolnikov, da preverimo, ali je ta mutacija prisotna, je dejal Shastri.

Tudi v razloženo | Nova raziskava: s kalcijem bogate nosne soli dokazano zmanjšujejo izdihani aerosol

Je razširjena v Indiji?

Lancet je objavil prednatis o ponovni okužbi s Covid-19 pri štirih zdravstvenih delavcih v Mumbaju. Študija bolnišnice Kasturba, Mednarodnega centra za genetski inženiring in biotehnologijo ter CSIR-Inštituta za genomiko in integrativno biologijo je pri treh odkrila mutacijo D614G. Pri enem zdravniku, ki se je ponovno okužil drugič, je bila prisotna mutacija D614G. Pojavili so se hudi simptomi in je potreboval plazemsko terapijo. Vendar ne moremo biti prepričani, da bomo D614G neposredno povezali z resnostjo okužbe, je dejal Shastri.

Pri drugem zdravniku je bil D614G prisoten pri prvi okužbi, vendar ni povzročil hudih simptomov.

Ali lahko mutacija povzroči smrt ali se jo je mogoče spopasti s cepivi, ni povsem znano. Nekatere študije so pokazale, da ne vodi do hude okužbe v pljučih.

Je to cilj cepljenja?

Njegova številčnost ponuja raziskovalcem možnost, da preučijo in usmerjajo njegov mehanizem. Pfizer dela na kandidatu za cepivo, v katerem bodo protitelesa blokirala domeno, ki veže receptorje v virusu. Nemško preskušanje cepiva je pokazalo obetavne rezultate proti sevu D614G.

Prednatisnjeni dokument v Biorxiv 2. septembra je bil optimističen, da mutacija morda ne bo zmanjšala učinkovitosti cepiva proti njej.

Delite S Prijatelji: