Pojasnjeno: Kako deluje test TrueNat

Virus SARS-CoV-2, ki povzroča Covid-19, nima DNK, ampak molekulo RNA. Postopek reverzne transkripcije (RT v RT-PCR) pretvori RNA v molekulo DNK, preden se gen lahko ujame v test.

Testni vzorec se naloži na čip TrueNat. (Vir: Molbio Diagnostics)

Pred nekaj tedni je Indijski svet za medicinske raziskave (ICMR) odobril uporabo Stroji TrueNat , ki ga proizvaja podjetje s sedežem v Goi, za izvajanje potrditvenih testov za bolezen Covid-19. Pred tem so se ti aparati, ki so bili prvotno razviti za odkrivanje tuberkuloze pri bolnikih pred nekaj leti, v trenutni pandemiji koronavirusa uporabljali le za presejanje bolnikov.

Po odobritvi ICMR te naprave zdaj iščejo številne države, zlasti tiste, ki nimajo močne laboratorijske mreže, ki je potrebna za izvajanje tradicionalnih testov RT-PCR. Medtem ko ima Uttar Pradesh 117 strojev, ki jih je treba razporediti v vseh svojih 75 okrožjih, je Bihar naročil 50 strojev. Jharkhand, Chhattisgarh, Odisha, Telangana, Andhra Pradesh so vsi iskali te stroje in mnogi od njih so že bili nameščeni.

Kako deluje TrueNat?

Da bi to razumeli, pomaga razumeti, kako delujejo tradicionalni testi PCR. PCR je metoda za zajemanje specifičnega gena iz DNK v vzorcu brisa in njegovo razmnoževanje z vrsto kemičnih procesov, tako da ga je mogoče zaznati s fluorescenčnimi barvili. Večina sodobnih PCR testov, ki se uporabljajo tudi za odkrivanje drugih vrst virusov, deluje v realnem času. Rezultat je viden tudi, ko poteka verižna reakcija.

Virus SARS-CoV-2, ki povzroča Covid-19, nima DNK, ampak molekulo RNA. Postopek reverzne transkripcije (RT v RT-PCR) pretvori RNA v molekulo DNK, preden se gen lahko ujame v test.

TrueNat je baterijski komplet za RT-PCR, ki temelji na čipu. Sprva je lahko identificiral le E-gen v virusu SARS-CoV-2. To je gen, ki virusu pomaga zgraditi sferično ovojnico okoli sebe. Na tej točki so bili kot presejalni test uporabljeni stroji TrueNat. Vzorce, ki so bili odkriti z E-genom, bi lahko poslali na potrditvene RT-PCR teste v laboratorije. Toda novi stroji so zdaj opremljeni za odkrivanje encima RdRp, ki ga najdemo v virusni RNA, in zato je ICMR odločil, da se ti testi lahko obravnavajo kot potrditev prisotnosti novega koronavirusa.

Velika razlika je v tem, da je stroj prenosen in testi z njim stanejo veliko manj kot tradicionalni RT-PCR testi. Zaradi tega je izjemno uporaben za uporabo v notranjih okrožjih in oddaljenih krajih, od koder je zbiranje in pošiljanje brisov na testiranje v velikih mestih težka naloga. Pravzaprav so bili ti stroji že nameščeni v vaseh severnega obalnega pasu Andhra Pradesh in v gozdnatih regijah okrožja Gadchiroli.

Kako poteka test?

Ko bris zberemo v kioskih, ki so postavljeni na teh mestih, ali v zadrževalnih conah ali zdravstvenih taboriščih, ga potopijo v medij za prenos virusa, kjer se nevtralizira. V primarnem zdravstvenem domu ali bližnjem laboratoriju ga prenesejo v drugo tekočino, virusno lizo, v kateri se celice razbijejo in nečistoče odstranijo. Del te tekočine se nato prenese v kartušo, ki je videti kot sploščena kaseta s trakom in je vstavljena v stroj, zelo podoben kasetofonu. Gumb za predvajanje aktivira postopek. V samo približno 20 minutah postopek ekstrahira RNA, podpisni nabor genomskih navodil, ki celici ukazujejo, naj pomnoži virus, ko ta vstopi v človeško celico. Ta izvleček RNA se nato prenese v drug stroj, kjer se tekočina spusti v miniaturno vdolbino, ki je pritrjena na elektronski čip, ki ni večji od človeškega palca.

Medtem ko je miniaturni vodnjak kraj, kjer reagent aktivira RNA, je čip, ki se hrani z vsemi izračuni virusne obremenitve, ki pomaga pri odkrivanju, ali oseba nosi virus ali ne. Za razliko od običajnih RT-PCR testov reagenti pri tem procesu ne zahtevajo ekstremnih temperatur, poleg tega je za testiranje potrebna tudi količina brisa.

Glede na to, da so bili stroji razviti za testiranje na tuberkulozo, so se morali prilagoditi za testiranje na Covid-19?

Stroj, ki ga je zasnoval Molbio Diagnostics Private Limited iz Goe, je bil prvotno razvit za diagnozo tuberkuloze, ki vsako leto prizadene vsaj milijon otrok. Kot rezultat vsaj desetletja raziskav je te stroje šele pred kratkim odobrila Svetovna zdravstvena organizacija (WHO), ki je potrdila, da so ti stroji pokazali podobno natančnost kot drugi komercialni izdelki, ki jih je odobrila SZO za ta namen. Ti stroji so bili pripravljeni za uporabo od aprila letos.

Takrat se je zgodil Covid, je povedal Shiva Sriram, nacionalni vodja prodaje Molbio Diagnostics, ki sedi v proizvodnem oddelku v Goi. Tuberkuloza zahteva zgodnje odkrivanje, zato je pomembna natančna diagnoza. Za razliko od mikroskopije razmaza, ki ima natančnost 50:50, smo želeli doseči boljšo natančnost in nadaljevali z raziskavami. To je bilo 18 let raziskav ..., je dejal.

Srce naprave je zasnovano za odkrivanje različnih vrst okužb. Čip je specifičen za vsako okužbo. Podjetje je potrebovalo 15 dni za oblikovanje čipa, ki je imel vso diagnozo virusne obremenitve za odkrivanje koronavirusa.

Po Sriramovih besedah ​​je bilo podjetje zaposleno z urejanjem dostave za seznam prejemnikov, ki mu ga je zagotovilo Ministrstvo za zdravje za diagnostiko tuberkuloze. Petsto strojev je bilo razdeljenih med vse države in sindikalna ozemlja. Po tem so države začele same oddajati naročila. Danes je že rezerviranih okoli 1000 strojev, v naslednjih dveh mesecih pa pričakujemo še od 3000 do 4000, je dejal.

Goa je bila tista, ki je prva kupila nov spremenjeni stroj za presejanje Covid-19. Toda Andhra Pradesh je bila država, ki ga je najbolj uporabljala, saj je opravila več kot 2,5 milijona presejalnih testov.

Povpraševanje se je povečalo, ko so začeli naraščati primeri v državah, kot so Bihar, Uttar Pradesh in Odisha, saj so se migranti začeli vračati v drugem tednu maja. Stroj je že omogočil raziskave od vrat do vrat v mnogih delih teh držav.

Kako se TrueNat primerja z običajnimi testi?

Običajna RT-PCR zahteva, da se ekstrakcija in analiza RNA opravita v dveh različnih prostorih, podprtih s hladilnim skladiščem in usposobljenimi strokovnjaki, ki ravnajo z laboratorijsko zasnovano opremo. TrueNat je po drugi strani zasnovan predvsem za delo na oddaljenih lokacijah in se šteje za 'diagnostiko zadnje milje'.

Stroj je prenosen in ga lahko nosite v aktovki, deluje na baterije z enim polnjenjem, ki zdrži deset ur. Osemurna izmena omogoča 45 testov in večina držav trenutno izvaja tri izmene na dan, je dejal Sriram. Večina držav je naročila tudi štiri igralne avtomate, ki omogočajo hkratno izvedbo štirih testov, je dejal.

Vsak od štirih igralnih avtomatov stane več kot 13.000 Rs, testni komplet pa je na voljo le za približno 1.300 Rs.

Delite S Prijatelji: