Pojasnjeno: različica B.1.617 in porast Covid-19 v Indiji

Podatki o sekvenciranju genoma so predstavili dokaze o 'dvojnem mutantu' v 61 % vzorcev v Maharaštri. Toda ali ta nova različica poganja nenehni porast Indije, je mogoče reči šele, ko bo na voljo več podatkov.

Zdravstveni delavci pripravljajo postelje v banketni dvorani Shehnai v New Delhiju, ki je bila preurejena v začasni oddelek za bolnike s Covid-9. (Ekspresno foto: Amit Mehra)

Med srečanjem z okrožnimi laboratoriji v Maharaštri prejšnji teden je Nacionalni inštitut za virusologijo (NIV) delil omejene podatke, ki kažejo na razpad 361 vzorcev z zaporedjem genoma, zbranih med januarjem in marcem letos.

Naslovna ugotovitev iz analizo : prisotnost dvojne mutacije je bila odkrita v 220 - skoraj 61 odstotkih - vzorcev. Ta dvojna različica je bila prejšnji teden razvrščena kot različica B.1.617.

glasilo| Kliknite, da dobite najboljše razlage dneva v mapi »Prejeto«.

Kaj je B.1.617?

Različica SARS-CoV-2 B.1.617 nosi dve mutaciji, E484Q in L452R. Oba najdemo ločeno v številnih drugih različicah koronavirusa, vendar so v Indiji prvič poročali o njih skupaj.

Dve mutaciji najdemo v virusnem spike proteinu. Beljakovina spike pomaga virusu, da se veže na receptorje človeške celice in vstopi v gostiteljsko celico.

Mutacija E484Q je podobna E484K, mutaciji, ki jo najdemo v različicah koronavirusa v Združenem kraljestvu (rod B.1.1.7) in Južni Afriki (B.1.351).

Mutacijo L452R so odkrili v hitro razširjenih različicah v Kaliforniji (B.1.427 in B.1.429). Lahko poveča moč vezave spike proteinov z receptorji ACE2 na človeških celicah, zaradi česar je bolj prenosljiv. L452R lahko potencialno poveča tudi razmnoževanje virusa.

E484Q in L452R sta skupaj bolj nalezljiva in se lahko izogneta protitelesom.

Kje so našli B.1.617?

Podatki so omejeni. Prvič so poročali iz Maharaštre. Januarja je bilo sekvenciranih 19 vzorcev iz različnih okrožij, B.1.617 pa je bil ugotovljen v štirih. Februarja je bilo sekvenciranih 234 vzorcev iz 18 okrožij, 151 vzorcev - iz vsaj 16 okrožij - pa je imelo to različico. In marca ga je imelo kar 65 od 94 vzorcev.

Doslej so okrožja Amravati, Nagpur, Akola, Wardha, Pune, Thane, Aurangabad in Chandrapur predstavila močne dokaze o prisotnosti B.1.617. V drugih okrožjih je bilo sekvenciranih manj vzorcev, v nekaterih pa je bila najdena različica. Za več vzorcev čaka zaporedje.

PRIDRUŽI SE ZDAJ :Telegramski kanal Express Explained

Je ta varianta bolj virulentna?

Zaenkrat ni nobenih dokazov. Večina bolnikov lahko opravi domačo izolacijo, čeprav je za pridobitev znanstvenih dokazov treba klinične izkušnje združiti s podatki o sekvenciranju genoma. Klinične anekdote zdravnikov kažejo, da se ta varianta širi hitreje, je bolj nalezljiva, lahko okuži cele družine, vendar je manj virulentna in ne povzroča dramatično več hospitalizacij.

Večina bolnikov je asimptomatskih in to je dober pokazatelj. Toda v absolutnih številkah je toliko primerov obremenilo zdravstveno infrastrukturo, je dejal dr. Shashank Joshi, strokovnjak delovne skupine Maharashtra Covid.

Koliko se je razširilo?

Dr Sujeet Singh, direktor Nacionalnega centra za nadzor bolezni (NCDC), je poudaril, da je bilo do zdaj sekvenciranih zelo malo vzorcev iz Maharaštre in je prezgodaj za dokončne sklepe o tem, kako razširjen je dvojni mutant. Vendar je centralna vlada marca poročala, da ima 15-20 odstotkov vzorcev v Maharaštri to različico; na podlagi najnovejših podatkov o zaporedju vemo, da je ta številka zdaj več kot 60 odstotkov.

Zdravniki in okrožni upravitelji v Maharaštri poročajo, da se v drugem valu za razliko od prvega vala okužijo cele družine. To bi lahko pomenilo, da so ukrepi fizične distanciranja in izolacije v gospodinjstvu neustrezni ali da je virus postal bolj prenosljiv.

Ali bi lahko B.1.617 povzročil nenehni porast primerov Covid-19?

Dr Gangandeep Kang, profesor mikrobiologije na Christian Medical College, Vellore, je dejal, da je 60,9 odstotka vzorcev s to različico najverjetneje pokazalo povezavo med mutacijo in porastom - vendar je za natančen odgovor vsaj 1 odstotek vzorcev Covid-19 je treba zaporediti vsak teden. Indija trenutno testira več kot 1000 primerov na dan, kar bi pomenilo približno 1000 zaporedij genoma vsak dan.

Pogledati moramo tudi, koliko ljudi lahko okuži oseba, in prag cikla RT-PCR. Slediti moramo v živo. Podatki iz januarja imajo v aprilu malo vrednosti, je dejal dr. Kang.

Dr Gautam Menon, profesor na univerzi Ashoka, Sonepat, in na Inštitutu za matematične vede v Chennaiju, je dejal: Kar imamo, je sugestivno, vendar potrebujemo več podatkov o sekvenciranju genoma, da bi razumeli, katera različica povzroča število novih okužb v različnih državah ... Za domnevo, da je porast primerov posledica te dvojne mutantne različice, bi morali imeti več časovnih točk. Na primer, če bi lahko rekli, da smo 30. marca v vzorcih odkrili 30 odstotkov te variante, 14. aprila pa 40 odstotkov v vzorcih, bi to pomenilo, da nova varianta prevladuje v širjenju bolezni.

Tudi dr. Menon je poudaril potrebo po večji preglednosti podatkov. Možno je, čeprav vse manj verjetno, da bi bili primeri povezani tudi s prejšnjim sevom, je dejal. Če ne vemo, v kolikšni meri je povečanje mogoče pripisati novi varianti, ne bomo mogli dokončno ugotoviti, ali so sprostitve v Covidu primernem vedenju s starejšim sevom povzročile povečanje ali je za to odgovorna povečana infektivnost nove variante.

Profesor Vinod Scaria, glavni znanstvenik, CSIR -IGIB, se je strinjal, da ne moremo dokončno reči, da te različice povzročajo porast v drugem valu. Vendar pa dokazi kažejo, da vsaj v nekaterih državah prevladuje rod B.1.1617 in bi lahko prispeval k povečanju števila primerov, je dejal. To linijo opredeljuje 15 genetskih variant, vključno s šestimi različicami spike proteina. Dva od teh (E484Q in L452R) sodelujeta pri imunskem pobegu in povečani infektivnosti, je dejal profesor Scaria.

Ali se varianta lahko izogne ​​cepivom?

Ponovno so podatki omejeni. Nekateri ljudje so se res okužili že po prvem odmerku, vendar ni podatkov o tem, ali so bili njihovi vzorci poslani na sekvenciranje genoma.

Vemo, da je južnoafriška varianta bolj sposobna ubežati imunskemu odzivu. Vemo, da je različica UK najbolj prenosljiva. Toda o B.1.617 zaenkrat ne vemo ničesar, ker podatkov ne združujemo, da bi sklepali, je dejal dr. Kang.

Dr. Menon je poudaril, da čeprav ni pričakovati, da bodo cepiva preprečila okužbo, zagotovo preprečijo hude bolezni in smrt. Pričakujemo, da bo to ostalo res tudi pri novi različici. Edina srednje- do dolgoročna rešitev za spopadanje s Covid-19 je, da se ljudje cepijo.

Delite S Prijatelji: